지방이 적은 육산(lean meat yield)과 육질(meat quality) 간의 유전적 길항 관계는 돼지에서 정밀한 선발의 필요성을 시사합니다. 본 연구는 단말 부계 계통(Duroc [D], Pietrain [P], 그리고 이들의 F1 교잡종 [PD])이 생산 형질에 미치는 영향을 평가하고, 1,295두의 상업용 집단을 대상으로 전장유전체 연관분석(GWAS)을 수행하였습니다. 결과적으로 뚜렷한 유전적 상충관계(trade-off)가 나타났으며, D 부계에서 생산된 자돈은 근내지방(IMF) 및 육색에서 우수한 값을 보였고(p < 0.05), 반면 P 부계 자돈은 등심 면적과 지방이 적은 특징에서 뛰어난 결과를 보였습니다. PD 교잡종은 대부분의 형질에서 중간값을 보였으나, 주된 생산 형질에 있어 순종 단말 부계 그룹을 능가하지는 못했습니다. GWAS에서는 늑골수(rib count) 관련 VRTN 유전자좌(SSC7:97575068_A_G, p = 2.30e-39) 및 도체장(carcass length) 관련 BMP2 유전자좌(SSC17:15820953_G_A, p = 1.59e-09) 등 주요 QTL이 재확인되었습니다. 늑골수는 보정 도체 직선장(adjusted carcass straight length)과 양의 상관(r = 0.393, p = 5.80e-31)을 보였으며, VRTN과 BMP2 유전자좌의 복합 유전자형 분석을 통해 축축(axial skeleton) 형질에 대한 공동 효과도 확인되었습니다. 드립로스(drip loss, SSC13, SSC14)와 근섬유 둘레(myofiber perimeter, SSC1)에 대한 신규 QTL도 발견되었으며, TUSC1이 후보 유전자로 제시되었습니다. 본 연구 결과, PD 교잡종은 지방이 적은 육산-육질 간 상충을 완화하지 못했으며, VRTN 및 BMP2 유전자좌와 더불어 새롭게 발견된 형질 연관 마커들이 교잡종 육종 프로그램에서 유망한 선발 타겟임을 시사합니다.