본 연구는 7년간(2017-2024) 체코에서 얻은 Staphylococcus aureus 클론 복합체 398(CC398)의 게놈 다양성과 집단 구조를 밝히기 위해 전체 게놈 시퀀싱을 활용하였습니다. 인간 환자로부터 분리한 1,129개 MRSA 균주 중 59개의 CC398 균주가 확인되었으며, 이들은 핵심 게놈 SNP와 전체 게놈 MLST 기반 계통발생적 재구성을 통해 특성화되었습니다. 연구 결과, 계통학적으로나 임상적으로 뚜렷이 구분되는 두 개의 계통이 확인되었습니다. ST1232 계통(n=27)은 팬톤-발런타인 류코시딘(PVL)과 면역 회피 클러스터(IEC) B형을 보유한 인간 적응형 지역사회 연관(CA) MRSA 클론으로, 2022년 이후 급격한 유병률 증가를 보였습니다. 계통발생학적 분석 결과, 주로 동남아시아로의 해외 여행과 관련된 복수의 독립적 유입이 확인되었고, 이후 가정과 취약 계층 내에서 지역적 확장이 이루어졌음을 시사합니다. 반면, ST398 계통(n=32)은 돼지 관련 클론(SCCmec Vc)과 말 관련 하위계통(C6-EP5-Leq; SCCmec IVa, IEC E형)을 포함하여 다양한 하위계통으로 구성되었습니다. ST398은 주로 의료기관 내 집락 또는 만성질환 환자의 장기 지속 감염과 관련이 있었습니다. 본 연구 결과, CC398이 특화된 환경 내에서 유전적으로 다양화되고 있으며, ST1232와 같은 독성이 강한 계통이 성공적인 지역사회 연관 MRSA 클론(예: USA300)의 초기 진화 경로와 유사하게 확산하고 있음을 시사합니다. 이번 연구는 가축 유래 하위계통과 인간 적응형 계통(ST1232 등)이 동시에 확산되면서 복잡성이 증가하는 CC398의 역학을 조명하며, ‘원 헬스(One Health)’ 체계 내에서 지속적인 게놈 감시의 필요성을 강조합니다.