집돼지(Sus scrofa)는 다양한 환경과 사양 관리 체계 하에서 가축화되어, 유전적 구조와 생리적 조절에 폭넓은 다양성을 지니게 되었습니다. 이러한 다양성은 전통적인 사육 방식 하에서 보존되어온 토착 품종에서 유지되고 있으며, 토착 및 상업 계통의 특성을 통합하기 위해 고안된 현대 교잡 육종 프로그램을 통해 더욱 확장되었습니다. 본 연구에서는 이러한 계통 간 다양성이 구조적 유전체 수준에서 어떻게 반영되는지를 조사하기 위해, 13개 집단에 속하는 110두의 돼지를 대상으로 전장 유전체 시퀀싱 데이터를 분석하여, 유전체 전반의 복제수 변이(CNV) 패턴을 특징짓고 계통별로 차별화된 CNV 영역을 확인하였습니다. 비교 분석 결과, 토착 그룹과 상업 그룹 간에 뚜렷하게 구분되는 CNV 분포가 확인되었으며, 총 282개의 유의적으로 차별화된 CNV 영역(CNVRs)이 도출되었습니다. VST 및 Wilcoxon 검정에 기반한 선발 신호 분석에서는 지방 대사와 관련된 유전자(FAR2, MGLL, FASN)가 강조되어 CNV 차이가 토착 품종의 특유 지방 축적 형질의 기저에 있을 수 있음을 시사합니다. 동일 분석 프레임워크 내에서, 교잡 집단은 부모 계통의 영향과 일치하는 유전 패턴을 보였는데, 토착 유사 CNVRs에는 지방 관련 유전자(ADIPOR1, MLXIPL, GPIHBP1)가, 상업 계통 유사 CNVRs에는 근육 발달 및 성장 관련 유전자(CAPN1, PDGFA, EEF1A2, SH2B1)가 포함되어 있었습니다. 이러한 결과는 복제수 변이가 돼지에서 과거의 적응 및 선발 육종 효과를 어떻게 반영하는지에 대한 유전체적 통찰을 제공합니다. 해당 CNVRs에는 지방 축적 및 근육 생물학과 관련된 유전자가 포함되어 있어 계통 간 형질 다양성과의 잠재적 연관성을 시사합니다. 본 연구는 향후 복제수 변이와 기능적 형질을 결합한 연구의 유전체적 기초를 제공하며, 구조적 변이의 분석이 교잡 및 품종 개량 전략 수립에 있어 중요한 정보를 줄 수 있음을 강조합니다.