임신 후기 및 모유 수유기 동안 발생하는 고온 스트레스는 모돈의 생리 및 생산성을 저해하며, 이는 스트레스 반응, 염증, 장 건강의 변화와 일부 연관되어 있다. 본 연구에서는 고온 스트레스 환경에서 우수한 성적을 보인 모돈으로부터 분리한 새로운 Limosilactobacillus reuteri 균주가 이러한 악영향을 완화할 수 있는지 평가하였다. 본 실험에는 3산차 및 4산차 모돈 각각 20두(총 40두, 평균 시작 체중: 243.1 ± 18.2 kg)가 투입되어, 정상 온도 대조군(TN)과 세 종류의 고온 스트레스 처치군에 배정되었다: 무보충 고온 스트레스(HS), 4.65 log CFU/g L. reuteri 투여군(HS5), 4.95 log CFU/g L. reuteri 투여군(HS10). 모돈의 생산성, 스트레스 지표, 염증성 사이토카인, 항산화 상태, 장 건강 마커, 분변 미생물 구성을 평가하였다. 이유기 동안의 사료 섭취량은 TN군 및 HS10군에서 HS군에 비해 높았다. 포유자돈군의 성적에는 군 간 유의적 차이가 없었다. 단, 이유 시 자돈 무게는 TN과 HS10군에서 HS 및 HS5군보다 유의적으로 증가(p = 0.015)했다. 고온 스트레스를 받은 모돈은 호흡수가 증가하였다. 모발 내 코티솔 농도는 TN군이 모든 고온 스트레스 처리군보다 낮았다. 혈청 내 TNF-α, IL-10, IL-1β 농도는 TN군이 고온 스트레스군보다 낮았다. 혈청 zonulin 농도는 HS군이 TN군 및 HS10군에 비해 높았고, occludin 농도는 TN군이 모든 고온 스트레스군보다 낮았다. 문(phylum) 수준에서 Firmicutes, Bacteroidota, Spirochaetota의 상대적 풍부도는 군 간 차이가 없었다. 과(family) 수준에서는 Pirellulaceae가 HS군에서 HS5, HS10군에 비해 높은 경향을 보였다. 속(genus) 수준에서는 Terrisporobacter가 HS10군에서 HS, HS5군보다 상대적으로 높았다. 또한 CPla-4_termite_group의 풍부도는 HS군에서 증가하는 경향을 보였다. 4.95 log CFU/g로 투여한 모돈 유래 L. reuteri 균주는 고온 스트레스 환경에서 사료 섭취량과 자돈의 성장 개선, 염증 및 장 장벽 지표 조절 효과를 보였으며, 전체 미생물 군집 구조에는 미미한 영향만을 나타냈다.