지속 가능하고 효율적인 동물 생산 시스템에 대한 전 세계적 관심이 높아지면서, 미생물군을 표적으로 한 영양 전략이 주목받고 있습니다. 본 리뷰는 가금류, 돼지, 반추동물, 어류, 새우를 비롯한 주요 축산 및 수산 분야에서 건강상의 이점을 제공하는, 선택적으로 이용되는 미생물 기반 기질(프리바이오틱스) 및 유익한 생균제(프로바이오틱스)에 관한 최신 연구를 종합적으로 고찰합니다. 특히, 종 특이적인 장내 미생물군이 동물의 건강과 생산성 조절에 미치는 근본적 역할을 다루며, 프리바이오틱스가 단독 또는 프로바이오틱스와의 시너지 조성물 형태로 장내 미생물군을 어떻게 조절하는지 설명합니다. 주요 작용 기전에는 영양분 소화율 향상, 장 내 형태 및 장벽 기능의 개선, 유익한 세균(예: Lactobacillus, Bifidobacterium) 선택적 증진, 병원균(예: Escherichia coli, Salmonella, Vibrio) 억제, 자연 및 체액성 면역 반응의 증진이 포함됩니다. 다양한 연구에서 미생물군 표적 영양 개입이 증체량, 사료효율, 도체 품질 등 주요 생산성 지표를 개선하고, 동물복지와 환경·생리적 스트레스에 대한 동물의 저항성을 높이는 것으로 일관되게 나타났습니다. 중요한 발견 중 하나는 이러한 접근법이 항생제 사용 의존도를 낮춤으로써 항생제 내성 문제를 해결하고, 윤리적이고 자연친화적인 생산 시스템을 선호하는 소비자 요구와 부합한다는 점입니다. 또한, 본 리뷰는 과일박과 곡류 부산물 등 농산업 부산물 및 Hermetia illucens(검정 군대파리)와 같은 신소재를 기능성·경제성 원료로 활용하여 동물 영양이 순환형 바이오경제 내에 내재될 수 있음을 강조합니다. 육상 및 수생 동물 종을 아우르는 다학제적 최신 연구를 통합해 볼 때, 미생물군 기반 기능성 영양학은 차세대 지속 가능한 동물 생산을 진전시키는 데 필수적임을 확인하며, 생산성·환경보호·동물복지를 결합함으로써 전 세계적으로 안전하고, 윤리적이며, 기후 회복력이 강화된 식품 시스템 조성을 지원합니다.