간염 E 바이러스(HEV) 감염은 날것이나 덜 익힌 돼지고기 제품을 통해 인간에게 전염될 수 있는 새로운 인수공통감염병입니다. 식품에서 바이러스를 검출하는 여러 방법이 기술되었지만, 정성적 및 정량적 성능 특성에 관한 데이터는 드뭅니다. 본 연구에서는 기존에 발표된 프로토콜을 결합하여 돼지 소시지의 HEV를 정량적으로 검출하기 위한 최적화된 방법을 개발하였습니다. 이 방법은 시료 파괴 및 트리-리제넌트와 1-브로모-3-클로로프로판을 이용한 상 분리, 그리고 이소프로판올 침전을 통한 RNA 농축을 활용합니다. 우리는 이 방법을 역전사 실시간 정량 PCR(RT-qPCR) 및 역전사 디지털 드롭릿 PCR(RT-ddPCR)에 사용할 수 있도록 검증하였습니다. RT-qPCR 및 RT-ddPCR 모두에 대해 검출 한계와 정량화 한계는 200 copies/g이었습니다. RT-ddPCR 기술은 이전에 RT-qPCR에 비해 더 정밀한 대안으로서 가능성을 보여주었습니다. 그러나 이 방법에서 RT-qPCR 대신 RT-ddPCR을 사용하여 성능이 개선되었다는 증거는 발견되지 않았습니다. 또한, 우리는 WHO 국제 표준 및 참조 패널을 사용하여 HEV RT-PCR 분석의 성능을 추가로 검증하였습니다. 마지막으로, RNA 농축 프로토콜과 RT-PCR 검출 전략의 다양한 조합을 평가했습니다. 이 결과, 억제제 내성 RT-qPCR 검출 전략을 사용할 때 바이러스 RNA의 이소프로판올 침전이 자성 실리카 비드 기반 추출보다 적어도 두 배 더 효율적임이 나타났습니다. 요약하자면, 우리는 돼지 소시지에서 HEV를 정량적으로 검출하기 위한 효율적이고 잘 특성화된 방법을 제시합니다. 이러한 방법은 위험 평가 및 식품 모니터링을 위한 고품질 데이터를 제공하는 데 유용합니다.