2009년 H1N1 팬데믹(pdm09) 계통은 매년 계절성 발병을 일으키는 H1 인플루엔자 A 바이러스(IAV)의 주요 구성 요소입니다. 2009-10 시즌에 소개된 이후, 이 계통은 사람들 사이에서 뚜렷하고 연속적인 클레이드로 진화했습니다. 인플루엔자 클레이드의 적합성을 예측하는 것은 미래의 유행을 예측하고 감염을 완화하기 위한 대응을 개발할 중요한 기회를 제공합니다. pdm09 계통의 상대적 적합성은 cocirculating 클레이드 간의 재생산 수의 상대적 차이를 추정하기 위해 갱신 방정식을 구현하는 프로그램인 RelRe를 통해 상대적 번식률(RRe)로 회고적으로 추론되었습니다. 이 분석을 위해, 2017년부터 2023년까지 미국에서 수집된 인간 및 돼지 숙주의 pdm09 계통 염기 서열이 공공 데이터베이스에서 다운로드되었습니다. 클레이드 지정은 Nextclade를 사용하여 할당되었습니다. 인간 사례 수 데이터는 각 인플루엔자 시즌별로 나누어졌고, RRe는 3개월 간격으로 추정되었습니다. RRe는 이후 90일 후의 클레이드 빈도를 예측하는 데 사용되었고, 예측은 역사적 데이터와 비교되었습니다. 90일 후 가장 높은 예측 빈도는 13번의 예측 중 9번(69%)에서 가장 자주 감지된 계통과 일치했습니다. pdm09 계통은 인간-돼지 인플루엔자 인터페이스에서 중요한 역할을 합니다. 인간 및 돼지 데이터를 함께 사용한 베이지안 추론은 pdm09 계통의 불평등한 전파율을 나타내며, 유전자 데이터를 통해 인간에서 돼지로 53-79건의 전파가 관찰되었고 그 반대의 경우는 0-2건에 그쳤습니다. 메타 데이터 분석은 인간에서의 클레이드 발생 약 8-20개월 후에 새로운 pdm09 클레이드가 돼지에서 감지되는 경우가 일반적임을 보여줍니다. RRe와 현대 IAV의 적합성을 이해함으로써 고위험의 역인수류주(反人獸流主) 계통을 식별할 수 있으며, 새로 발생하는 인간 클레이드에 대응할 중요한 시간을 제공합니다.