유산균(LAB)은 프로바이오틱으로서 잠재적인 적용 가능성을 가지고 있지만, 그들이 보유한 항생제 내성 유전자(ARGs)와 독성 인자 유전자(VFGs)는 중요한 공중 보건 위험을 초래할 수 있습니다. 이 연구에서는 대규모 농장의 돼지 분변 샘플에서 8개의 LAB 균주를 분리하고 이들의 프로바이오틱 가능성과 안전성을 인 비트로 기능성 실험 및 전체 유전체 서열 분석을 통해 체계적으로 평가하였습니다. 연구 결과에 따르면, Pediococcus pentosaceus R124는 장 상피 세포에 대한 높은 부착력(54.11%)과 강한 협집 능력(34.9%)을 보였습니다. Lactiplantibacillus plantarum Z108은 높은 산 내성(pH 2.0에서 생존율이 24.18%)을 나타냈으며, Enterococcus faecium F130는 높은 농도의 담즙 염에 대한 최고의 내성(6.28%)을 보였습니다. 모든 균주는 비용혈성 γ-용혈성 표현형을 나타냈으나, 항생제 감수성 테스트는 널리 퍼진 다중 내성을 나타냈습니다. 흥미롭게도, P. pentosaceus R124와 L. plantarum Z108은 특정 항생제에 대해 내성을 나타냈지만, 유전체 분석에서 획득된 ARGs나 VFGs가 존재하지 않아, 이들의 내성은 본질적인 메커니즘에서 기인할 수 있음을 시사합니다. E. faecium F130는 4개의 VFGs와 13개의 ARGs를 보유하고 있으며, 그 중 8개는 플라스미드에 위치하고 있습니다. 중요한 것은 여과 짝짓기 실험에서 E. faecium F130의 항생제 내성 플라스미드인 PlasmidE와 관련 내성 유전자 ANT(4')-Ib가 수용 균주로 수평 전이되어 항생제 내성을 부여할 수 있음을 보여주었습니다. 이 연구는, 모든 분리된 균주가 특정 프로바이오틱 가능성을 가지고 있지만, 이들의 안전성은 종과 균주 특성에 따라 다름을 시사합니다. P. pentosaceus R124와 L. plantarum Z108은 기능적 및 유전자적으로 안전한 유망한 후보자이며, E. faecium F130로부터의 내성 전이 위험성은 프로바이오틱 선별에서 전체 유전체 안전성 평가의 필요성을 강조합니다.