E형 간염 바이러스(HEV)는 선진국에서 식품 매개 전염으로 인해 점점 더 주목받고 있는 공중 보건 문제로, 대부분의 감염은 인수공통체 HEV-3 유전자형에 의해 발생합니다. 슬로바키아에서 인구의 E형 간염 병례가 증가함에 따라 식용 동물 집단 내의 상황에 대한 지식이 점점 더 중요해지고 있습니다. 4종의 식용 동물, 즉 돼지, 소, 양, 염소에서 수집한 290개의 샘플(2023년 3월부터 2025년 8월까지 수집)에서 HEV RNA의 검출이 수행되었습니다. 돼지 비육 단계에서 동일한 농장에서 유래한 120개의 대변 샘플 중 5개(4.2%)에서 실시간 RT-PCR로 HEV RNA가 확인되었습니다. HEV RNA의 유병률은 이전 결과에 비해 상대적으로 낮았으며, 이는 샘플링 전략의 제한을 반영할 수 있습니다. 선택된 ORF1과 ORF2 시퀀스의 계통 발생 분석 결과 이들이 HEV-3f 유전자형(HEV-3 그룹 1)에 속함을 보여주었습니다. 슬로바키아 돼지에서 이 유전자형의 존재는, 감염의 심한 경과를 보이는 슬로바키아 인간 환자에서 가장 흔히 설명되기 때문에, 인수공통 전염 가능성을 뒷받침합니다. 슬로바키아에서 돼지(n = 5/120)에서 HEV가 순환하고 있는 사실에도 불구하고, 소, 양, 염소(n = 0/170)에서는 HEV RNA를 검출하지 못했습니다. 이 연구 기간 동안 슬로바키아의 식용 반추 동물에서 HEV RNA의 부재가 확인되었으며, 이는 이러한 종들이 돼지에 비해 주요 HEV 저수지일 가능성이 낮다는 사실을 지적합니다. 지속적인 연구는 저수지 간의 HEV 순환을 추적하는 데 필수적일 것입니다.