돼지 번식 및 호흡기 증후군 바이러스 유형 2 (PRRSV-2)는 광범위한 유전적 다양성을 보이며, ORF5 기반 분류는 글로벌 분자 감시에 표준화된 틀을 제공합니다. 이전에 일본에서 진행된 전국 규모의 연구에서는 계통 4 (L4)가 예상보다 높은 유전적 다양성을 보이는 지배적인 계통으로 확인되었습니다. 이러한 관찰은 L4에 할당된 바이러스가 계통 내 다양화를 반영하는지 혹은 더 깊은 계통 발생학적 분리가 있는지를 확인하기 위한 집중된 재평가를 추진했습니다. 본 연구에서는 일본의 L4에 이전에 할당된 PRRSV-2 ORF5 서열을 글로벌 ORF5 분류 체계에 기반한 최대 가능도 계통 발생 재구성 및 쌍 별 뉴클레오타이드 거리 분석을 통해 재평가했습니다. 중복 서열 제거 후, 321개의 L4 할당 ORF5 서열이 글로벌 참조 데이터셋과 함께 분석되었습니다. 계통 발생 분석 결과, L4 할당 인구 내에 두 개의 분기군이 드러났습니다. 한 분기군은 글로벌 L4 참조 서열을 포함하고, 다른 하나는 주로 일본 서열로 구성된 독특한 단일계통군을 형성하였으며, 부트스트랩 값 ≥ 85%로 지지받았습니다. 쌍 별 비수정 뉴클레오타이드 p-거리 분석은 두 분기군 사이의 분기가 11% ORF5 계통 구분 기준을 초과한다고 보여주었습니다(분기군 간 중앙 p-거리 = 0.133). 계통 발생 및 유전적 거리 증거를 종합하여, 본 연구에서는 이 독특한 분기군을 JPL-A라는 잠정적인 명칭으로 표기하며 주요 L4 계통과 별개의 계통 수준의 분기군으로 보고합니다. 이러한 결과는 일본 내 현대 PRRSV-2 다양성이 역사적인 글로벌 참조에서 완전히 대표되지 않는 계통 수준의 그룹을 포함함을 나타내며, 지역 감시 데이터가 표준화된 ORF5 기반 분류 자원을 정교화하는 가치가 있음을 강조합니다.