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돼지 델타코로나바이러스 유전체의 RNA G-쿼드러플렉스: 구조적 조절 및 항바이러스 전략을 위한 치료 타겟팅

2026-08-01 07:00
돼지 델타코로나바이러스(PDCoV)는 전 세계 돼지 생산에 상당한 위험을 초래하는 신종 장관 코로나바이러스입니다. G-쿼드러플렉스(G4)는 여러 바이러스의 생명 주기에서 중요한 단계들을 조절하는 비정형 핵산 이차 구조로 알려져 있으나, PDCoV에서 RNA G4(RG4)의 존재와 생물학적 역할은 여전히 불분명합니다. 이 연구에서 우리는 생정보학 분석을 기반으로 PDCoV 게놈의 비구조 단백질 2(Nsp2) 및 M 유전자 내 G4 형성 서열(PQS)을 확인했습니다. 형광 활성화 시험 및 원형이색성(CD) 분광학을 통해 이들 PQS가 시험관 내에서 전형적인 평행 RG4 구조로 접힘을 확인했으며, 생세포 내 RG4 형성은 G4 특이 탐침을 사용하여 추가적으로 확인했습니다. 주목할만하게도, G4 리간드인 TMPyP4 및 피리도스타틴(PDS) 처리로 인해 PDCoV N mRNA의 양과 해당 단백질 발현이 유의하게 감소했으며, LLC-PK1 세포에서의 바이러스 적재량도 현저히 감소했습니다. 또한, Nsp2 및 M mRNA에서 발견된 RG4 구조가 전사 후 기전으로 번역을 억제하는 것으로 나타났습니다. 더구나 PDS 및 TMPyP4와 같은 G4 리간드가 Nsp2 mRNA의 RG4 구조를 타겟으로 하여 Nsp2-EGFP 융합 단백질 발현을 유의하게 억제했으며, M-EGFP 융합 단백질의 발현에는 영향을 미치지 않았습니다. 요약하자면, 우리의 연구는 PDCoV 게놈에 서열 보존적 기능 RG4 구조가 존재함을 뒷받침하며 PDCoV RG4를 타겟으로 하는 항바이러스 전략의 개발에 대한 새로운 통찰을 제공합니다.