아프리카돼지열병(ASF)은 가정돼지 및 야생 멧돼지에서 발생하는 바이러스 대유행으로, 최근 아시아, 유럽, 카리브해에서 발병이 있었습니다. 필리핀의 90% 이상의 지역이 영향을 받고 있지만, 현재 유행하는 특정 바이러스에 대한 정보는 제한적입니다. 본 연구에서는 2020년 필리핀 국내 농장에서 발병한 사례의 중심지에서 수집된 혈액 샘플을 통해 두 가지 ASF 바이러스(ASFV) 유전체의 종합적인 유전체 프로파일을 제시합니다. 비증폭 전체 유전체 시퀀싱 및 맞춤형 분석 파이프라인을 사용하여 80-99%의 유전체 시퀀스를 조립할 수 있었으며, 이를 통해 바이러스 유전자형(즉, 유전자형 2)을 결정하고, 필수적인 유전 표지자를 기반으로 아유전자형 프로파일을 식별하며, 현재 참조 균주에 비해 잠재적인 변종도 검출할 수 있었습니다. 이 보고서는 2019년 발병 이후 필리핀에서의 ASFV의 분자적 특성에 대한 심도 있는 기초 데이터를 제공합니다.
Key Points
- 아프리카돼지열병은 필리핀의 90% 이상 지역에 영향을 미치는 대규모 바이러스성 전염병입니다.
- 2020년 필리핀의 농장에서 수집된 혈액 샘플을 분석하여, 유전자형 2의 ASF 바이러스 유전체를 80-99% 조립해냈습니다.
- 본 연구는 2019년 이후 필리핀에서 ASF 바이러스의 분자적 특성에 대한 기본 데이터를 제공합니다.