바이러스 설사는 특히 여러 설사 관련 바이러스와 동시에 감염될 때 돼지 새끼의 건강과 성장에 심각한 위협이 됩니다. 이 연구에서는 중국 간쑤성의 한 농장에서 생후 3개월 이상의 돼지에서 항문 면봉을 수집하여 바이러스 메타게놈 분석을 수행했습니다. 이 돼지들은 설사를 겪고 있었고 그 성장이 상당히 저해된 상태였습니다. 고속 염기서열 분석(HTS)을 통해 22마리의 성장이 저해된 돼지와 3마리의 건강한 돼지로부터 채취된 혼합 샘플에서 총 18종의 바이러스가 확인되었습니다. 여기에는 성장이 저해된 돼지에서만 발견된 5종의 돼지 로타바이러스(PoRVs), 돼지 전염성 설사 바이러스(PEDV), 토로바이러스, 사펠로바이러스를 포함한 15종의 설사 관련 RNA 바이러스가 포함되었습니다. 확인된 PoRVs 중에서 PoRVB는 다른 PoRVs보다 훨씬 큰 유전적 다양성을 보였으며, 이를 통해 각 세그먼트 VP1 (2), VP2 (3), VP3 (4), VP4 (5), VP7 (5), NSP1 (2), NSP3 (3), NSP4 (2), NSP5 (4)에서 1~3개의 새로운 유전자형이 정의되었습니다. PoRVF는 돼지에서 처음으로 확인되었으며, 모든 유전자 세그먼트가 기존 조류 RVF 참조 균주와 비교하여 낮은 염기 서열(56.5%-79.4%) 및 아미노산 서열 유사성(46.2%-92.0%)을 보였습니다. 계통발생학적 분석에서 성장이 저해된 돼지에서 PAstV2 (6)와 PAstV4 (13)의 여러 변이 균주가 발견되었으며, 다른 장내 바이러스들은 참조 균주와 높은 상동성을 보였습니다. 전체적으로 이 발견은 성장이 저해된 돼지가 설사 관련 바이러스의 번식의 온상이 될 수 있음을 시사하며, 이들을 가능한 한 빨리 격리하고 치료해야 함을 나타냅니다.
Key Points
- 높은 염기 서열 분석을 통해 22마리의 성장이 저해된 돼지와 건강한 돼지로부터 18종의 바이러스가 확인되었습니다.
- 성장이 저해된 돼지에서 5종의 돼지 로타바이러스 등 설사 관련 RNA 바이러스들이 발견되었습니다.
- PoRVF가 돼지에서 처음으로 발견되었으며, 성장이 저해된 돼지는 설사 관련 바이러스의 번식의 온상이 될 수 있습니다.