돼지 유행성 설사 바이러스(PEDV)는 전 세계 돼지 산업에 심각한 위협을 가하는 주요 병원체입니다. 그 높은 변이성으로 인해 전통적인 백신은 예방과 통제에 한계가 있습니다. 본 연구에서는 중국에서 유통되는 1109개의 PEDV 균주의 분자적 특성과 진화 동력을 체계적으로 분석하였으며, 특히 그들의 S 유전자 서열에 중점을 두었습니다. 계통 발생 분석 결과 중국의 PEDV 균주는 두 가지 주요 그룹으로 분류될 수 있음을 보여주었습니다: GI(고전적)와 GII(변이형), 이들은 다시 여섯 개의 아형으로 나누어졌습니다: GIa, GIb, S-INDEL, GIIa, GIIb, GIIc. 이 중 GIIa가 35.62%, GIIb가 25.70%, GIIc가 26.06%로 총 아형에서 차지하였습니다. 지리적 분포 데이터에 따르면 광둥, 쓰촨, 허난이 PEDV 발병률이 가장 높은 지방임을 알 수 있었습니다. S 단백질의 아미노산 돌연변이 분석 결과 GII 균주가 '시아릴산 높은 친화성 + 면역 회피'라는 이중 전략을 통해 면역 압박 하에서 전파를 지속할 수 있음을 시사했습니다. 재조합 분석은 D0 구조성이 재조합 핫스폿으로 확인되어 PEDV의 종간 전파와 면역 회피를 유도할 가능성이 있음을 나타냈습니다. 당화 패턴 분석은 특히 N62와 N118에서의 고유한 당화 패턴을 보여주며, 이는 면역원성 변화와 관련이 있을 수 있음을 시사했습니다. 이 연구는 중국의 PEDV 균주들의 아미노산 돌연변이, 재조합 사건 및 당화 부위 변화 특성을 보고합니다. 이러한 발견은 PEDV의 진화적 메커니즘을 해명하고 백신 설계를 최적화하며 지역별 예방 및 통제 전략을 수립하는데 중요한 기초를 제공합니다.