이 연구는 돼지의 정액 품질과 항생제를 프로바이오틱스로 전환하는 항생제 없는 사료 프로그램 내에서 돼지의 분변 및 정액 미생물군집을 조사하는 것을 목표로 하였습니다. 듀록 돼지 7마리로부터 총 21개의 분변과 21개의 정액 샘플을 세 가지 시점(항생제 철회 전의 0일차, 대조군으로 사용, 48일차, 및 96일차)에서 수집하였습니다. 세 시점 동안 신선한 정액의 특성, 박테리아 배양 함량, 돼지의 분변 및 정액 미생물군집을 분석하였습니다. 수집된 정액은 항생제가 없는 정액 확장제로 희석되어 4일간 보관되었습니다. 저장 기간 동안 매일 정자의 품질과 박테리아 배양 함량이 평가되었습니다. 96일차에는 정자의 특성, 총 정자 운동성(-17.5 %, P = 0.024), 정자 생존력(-20.4 %, P = 0.002), 첨체 무결성(-25.8 %, P = 0.002)이 0일차에 비해 현저히 낮았습니다. 세 시점에서 총 박테리아 수 또는 Lactobacillus sp. 수는 유의한 차이가 없었습니다(P > 0.05). 그러나 항생제에서 프로바이오틱스로 전환 후 신선한 정액에서 그람 음성 박테리아의 비율이 0일차의 69.5%에서 96일차의 88.0%로 증가했습니다. 또한, E. coli의 비율은 0일차의 18.7%에서 96일차의 76.0%로 증가했습니다. 4일간의 저장 기간 동안 총 박테리아 수와 총 Lactobacillus sp. 수가 증가했습니다(P < 0.05). 정액 미생물군집 분석 결과, Enterobacterales(41.4%)가 정액 품질이 열악한 돼지에서 지배적 세균 군집인 반면, Bacteroidales(14.2%)는 정액 품질이 좋은 돼지에서 우세하였습니다. 정액 미생물군집의 클라도그램은 Gammaproteobacteria가 항생제에서 프로바이오틱스로 전환 후 96일차에 세균의 생체표지자로 확인되었습니다. 분변 미생물군집의 알파 및 베타 다양성은 0일차와 96일차 간의 유의한 차이를 보였으나(P = 0.048), 정액 미생물군집의 알파 및 베타 다양성은 유의한 차이를 보이지 않았습니다(P > 0.05). 결론적으로, Gammaproteobacteria, Enterobacterales 및 E. coli를 포함하는 그람 음성 조건 병원성 세균의 증가는 항생제에서 프로바이오틱스로 전환 후 정액 품질 저하와 관련이 있으나, 총 박테리아 또는 Lactobacillus sp. 수와는 관련이 없었습니다. 프로바이오틱스 보충은 분변 미생물군집 다양성을 변화시켰으나, 이는 정액 미생물군집 다양성이나 정액 품질에 영향을 미치지 않았으며, 분변과 정액 미생물군집 변화 사이의 연결도 없었습니다.