배경: 장내 미생물은 영양, 생리, 면역 과정 유지에 필수적이지만, Brachyspira hyodysenteriae (B. hyo)에 의해 유발되는 돼지 이질과 같은 대장 감염은 이러한 항상성을 방해합니다. 본 연구는 B. hyo로 도전받은 돼지의 대변, 대장 내용물 및 점막에서 샷건 및 전체 길이 16S rRNA 시퀀싱을 사용하여, 관심 있는 세균 분류군, 기능 및 메타게놈 조립 유전체(MAGs)의 고해상도 특성을 제공하고, 이를 주요 병원체와의 연관성 및 감염의 병리학적 변화에 의해 어떻게 영향을 받는지 밝힙니다.