고 병원성 중동호흡기증후군 코로나바이러스(MERS-CoV)를 포함하는 코로나바이러스의 아속인 Merbecovirus는 중대한 인수공통감염 위험을 가지고 있습니다. 숙주 적응과 이종 간 전달 가능성을 더 잘 이해하기 위해, 우리는 1967개의 Merbecovirus 서열에서 코돈 사용 패턴에 대한 종합적인 분석을 수행했습니다. 계통발생 분석을 통해 Merbecovirus가 7개의 뚜렷한 군으로 나뉘는 것을 확인했습니다. 코돈 사용 편향은 낮으며, 자연 선택에 의해 주로 형성되고, 게놈 전체에 걸쳐 일관된 A/U-rich 구성을 가집니다. 코돈 적응 지수(CAI)와 상대 코돈 비최적화 지수(RCDI) 분석은 Merbecovirus가 Sus scrofa(돼지), Equus caballus(말), Oryctolagus cuniculus(토끼)에 대한 숙주 적응의 잠재성을 보이며, 이종 간 전파의 위험성을 시사합니다. 눈에 띄게도, 이러한 게놈 수준의 적응 예측은 emerging functional evidence로 뒷받침됩니다: 최근 연구들은 주요 Merbecovirus 계보가 다양한 세포 진입 수용체(DPP4 또는 ACE2)를 활용한다는 것을 보여주었으며, 이는 숙주 기호성의 근본적인 결정 요인입니다. 예를 들어, HKU5 계열이 족제비류(Neogale vison)에서 ACE2 수용체를 활용할 수 있는 능력은 우리의 게놈 분석에서 추론된 숙주 적응 경향에 대한 기계적 지원을 제공합니다. 기존의 수용체 특이성 데이터를 통합하여, 이 연구는 Merbecovirus 아속 전체에서 코돈 사용에 대한 최초의 체계적이고 대규모 분석을 제공하며, 게놈 적응과 바이러스 진화의 중요한 메커니즘을 설명합니다. 우리의 분석 프레임워크는 숙주 다양성에 대한 새로운 비교 관점을 제공하며, 미래의 스필오버 위험을 완화하기 위한 특정 감시 우선 순위를 지적합니다.