세네카바이러스 A (SVA)는 2002년 미국에서 처음으로 분리된 피코르나바이러스이며, 1988년부터 돼지 집단에서 바이러스가 순환하고 있다는 증거가 있습니다. 2014년 이후 브라질에서 돼지의 SVA 감염으로 인한 수포성 질병 발생이 자주 보고됨에도 불구하고, 바이러스의 유전적 다양성과 진화에 대한 데이터는 제한적입니다. SVA는 수포 병변을 보이는 돼지에서 분리되었으며, 이는 2018년부터 2022년까지 브라질의 8개 주 57개 지방자치단체의 농장이나 도축장에서 유래한 샘플입니다. Sanger 및 Oxford Nanopore 시퀀싱을 통해 501개의 SVA 게놈을 획득하였습니다. 계통발생 분석 결과, 브라질의 SVA 시퀀스는 중국, 미국, 캐나다 등 타국의 시퀀스와 유전적으로 구별되며, 브라질 내에서 순환하는 바이러스의 공통 조상을 나타내는 단일계통군을 형성하는 것으로 나타났습니다. 또한, 중서부 및 남부 지역의 시퀀스로 구성된 두 개의 주요 군집이 있어, 브라질 내 돼지 집단에서 SVA가 독립적으로 진화하고 있음을 시사합니다. 쌍별 시퀀스 비교를 통해 브라질 SVA 시퀀스에서 높은 빈도의 고유한 7개의 돌연변이를 식별할 수 있었습니다. 특히, 이러한 돌연변이는 숙주 세포 수용체(ANTRX1)와 상호작용하는 캡시드 단백질의 특정 부위와 표면에 노출된 잔기에서 식별되어 수용체 상호작용 또는 면역압에 의한 잠재적 진화적 변화를 암시합니다. 재조합 분석은 브라질 균주 간 최소 다섯 번의 재조합 사건의 증거를 제공합니다. 이러한 발견은 브라질 내 순환하는 SVA의 진화와 바이러스의 전 세계적인 역학 및 진화에 대한 새로운 통찰력을 제공합니다.