골격근 섬유 조성은 육질과 대사 특성을 결정짓는 주요 요소입니다. 초기 생후 기간은 근섬유 전환의 주된 시기를 의미합니다. 본 연구에서는 비육형 및 중국 토종돼지의 2주령 장요근(longissimus dorsi) 근육의 형태학적 및 분자적 특성 분석을 통해 구별되는 근섬유 조성을 분석하였습니다. 다유전체 분석 결과, 유전적 염색질 상태, 인핸서 지형, 그리고 프로모터 활동 면에서 품종 간의 차이를 보였습니다. 비육형 돼지는 산화 대사와 근원 발생에 관련된 유전자 부위에서 염색질 접근성과 인핸서 활성화가 증가한 반면, 중국 토종돼지는 해당 및 생합성 부위에서 풍부한 조절 특성을 나타내었습니다. 품종 특이적인 SNP와 삽입-결실 변이는 특정 인핸서에서 농후하게 발현되며, 전사 조절에 잠재적인 영향을 줄 수 있습니다. 고차원 유전체 구조는 A/B 컴파트먼트 전환 및 TAD 경계 재구성을 통해 전사적 분화에 기여합니다. 프로모터-인핸서 상호작용 맵핑은 품종 특이적인 시스-조절 네트워크를 밝히고, 전사 출력은 인핸서 밀도와 상관관계가 있습니다. 기능적 검증 결과, PPP3CB의 상위 인핸서가 MEF2C를 모집해 산화 섬유 프로그램을 활성화함을 확인하였습니다. 인 비트로 및 인 바이보 변동 실험은 PPP3CB-MEF2C 피드백 루프가 근섬유 유형 명확화를 주관함을 입증하였습니다. 이 연구 결과는 초기 근섬유 특징을 설명하는 에피게놈 및 3D 유전체 구조를 제시하며, 육질 개선에 관련된 메커니즘적 통찰을 제공합니다.