FFPE 조직은 분자 테스트에 필수적이지만, 핵산의 품질은 전처리 요인에 의해 영향을 받습니다. 돼지 모델을 사용하여, 포르말린 농도, 고정 시간, 냉적출 시간, 조직 크기가 DNA와 RNA 품질에 어떻게 영향을 미치는지를 체계적으로 조사했습니다. 신선한 간을 2mm, 10mm, 50mm 크기로 잘라 10% 또는 20% 중성완충포르말린(NBF)에 1일, 3일, 또는 7일 동안 고정했습니다. 작은 샘플에서는 10% NBF가 DNA 품질을 20% NBF보다 더 잘 보존했으나, 큰 샘플에서는 이러한 차이가 없었습니다. RNA 품질은 포르말린 농도에 대한 민감도가 거의 없었습니다. DNA와 RNA 모두 1일부터 3일, 7일로 고정 시간이 늘어남에 따라 품질이 저하되었습니다. 다음으로 임상 FFPE 샘플을 사용하여 절단 후 보관의 영향을 평가했습니다. DNA와 RNA의 분열은 각각 1개월 이상 및 3개월 이상 후에 증가했으며, 이를 4°C 이하로 보관함으로써 방지할 수 있었습니다. 1년 미만의 FFPE 블록은 최적의 DNA 품질을 보였습니다. 이러한 결과는 다음과 같은 실용적 권장 사항을 제공합니다: (1) 24시간 이내의 10% NBF 사용; 대형 샘플의 경우 20% NBF도 허용될 수 있으나, 다양한 샘플 유형에 대한 적용 가능성은 검증되지 않았습니다, (2) 1년 미만의 블록을 선택, (3) 테스트 전 1개월 이내에 절단, (4) 보관이 1개월을 초과할 경우 4°C 이하에서 절단 보관.