가축에서 미탐색 시퀀싱 판독값에는 병원체에 관한 귀중한 정보가 포함되어 있으나, 일반적으로 폐기됩니다. 우리는 높은 보안성과 낮은 보안성 조건에서 사육된 닭과 돼지의 혈액 유래 DNA 및 RNA를 분석하여, 미탐색 판독값에 초점을 맞추었습니다. 닭의 경우, 낮은 보안성 농장에서 주로 식물 바이러스인 더 많은 바이러스 서열이 발견되어 환경적 오염을 의미했습니다. 돼지의 경우, 마이코플라스마 폐렴과 여러 돼지 특이 바이러스가 탐지되었습니다. 우리 연구에서는 숙주 판독값 제거, 조립, BLAST, 분류학적 필터링을 포함하는 생물정보학적 파이프라인을 통해 효율적으로 잠재적 병원체와 오염원을 식별했습니다. 이 접근 방식은 시퀀싱 기반의 환경 DNA 모니터링이 미생물 및 바이러스 존재를 추적하고, 농장 생물 안전성을 평가하며, 동물 건강 감시를 지원할 수 있는 가능성을 보여줍니다.