장내 미생물군은 숙주의 대사와 골격근 생리학의 주요 조절자로, 돼지의 근섬유 유형 전환에서의 역할은 여전히 명확하지 않습니다. 본 연구에서는 미생물 부재가 근육 발달에 미치는 영향을 탐구하기 위해 무균(GF) 및 특이성 병원체 프리(SPF) 롱청 새끼 돼지를 사용했습니다. GF 새끼 돼지는 SPF 대조군에 비해 체중이 크게 감소하고 빠른 수축 섬유의 비율이 증가했습니다. 전사체 시퀀싱을 통해 cGMP-PKG, 갑상선 호르몬, HIF-1, VEGF, 부티레이트 대사 경로 등 근섬유 명세에 필수적인 1332개의 차등 발현 유전자(DEGs)가 식별되었습니다. 비표적 대사체 프로파일링을 통해 담즙 분비에서 주요 변화가 관찰되는 320개의 차등 발현 대사체(DEMs)가 확인되었습니다. 통합 전사체 및 대사체 분석을 통해 DEGs 및 대사체와 함께 공동 강화된 10개의 KEGG 경로가 밝혀졌으며, 여기에 담즙 분비, 페롭토시스, TRP 채널의 염증 매개체 조절 및 HIF-1 신호 경로가 포함됩니다. 상관 분석에서 빠른 수축 섬유 유전자(PRKCA, MYOZ3, NFATC1 등)와 지방산 관련 대사체(도데카노산, 발프로산 및 데카노산 등)가 강한 양의 상관관계를 보였고, 담즙산 관련 대사체(콜산 및 7-케톨리토콜산 등)와는 음의 상관관계를 보였습니다. 이러한 결과는 미생물 대사체가 대사 및 신호 상호작용을 통해 근섬유 표현형과 연관이 있음을 시사합니다. 종합적으로, 본 연구 결과는 돼지에서의 장내 미생물 부재가 담즙산 대사와 지방산 대사를 방해하여 골격근 섬유 구성이 빠른 수축의 해당작질 섬유로 변화하도록 유도함을 보여줍니다. 이러한 대사체는 장내 미생물군과 돼지 근섬유 유형 전문화의 전사 조절 기능을 연결하는 주요 미생물 매개체로 확인되어, 장-근육 축에 대한 새로운 통찰력을 제공하고, 돼지 근섬유 구성과 대사 균형 유지에서 미생물 유래 대사체의 중요한 역할을 강조합니다.